Hier eine Kurzanleitung, um libSBML (in meinem Fall 4.01) unter Linux Mint 8 (Codename “Helena”) mit KDE für Python 2.6 zum Laufen zu bekommen. (Gilt natürlich genauso für Ubuntu 9.10 und Kubuntu 9.10.

In der Konsole, im Verzeichnis vom libSBML-Quellcode:

sudo apt-get install build-essential libxml2 libxml2-dev python-dev
./configure –with-python
make
sudo make install
sudo ldconfig
export PYTHONPATH=/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/libsbml:/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/
python
(in der python shell) from libsbml import *

Keine Fehlermeldung? Dann hat’s geklappt. (Hinweis: In der zweiten Zeile werden die beiden Bindestriche von Wordpress als langer Gedankenstrich dargestellt. Es muss aber natürlich “- -with-python” ohne das Leerzeichen heißen.)

Für eine anstehende Softwareentwicklung brauche ich ein ordentliches Linux als Entwicklungssystem. Dabei findet man nicht immer alle Pakete, die man so braucht, in irgendwelchen Repositories. Eben bin ich darüber gestolpert, dass die Library libSBML nicht so einfach zu bekommen ist.

Die Auflistung der Schritte, die fürs Kompilieren notwendig sind, sind eigentlich mehr als Erinnerung für mich, weil ich dasselbe auf einem anderen System bald wieder machen muss. Aber vielleicht hilft es ja auch noch irgendwem da draußen.

Update vom 20.5.2010: Funktioniert genauso auch unter Ubuntu 10.04 (und damit höchstwahrscheinlich auch Kubuntu 10.04). Klappt außerdem sowohl für 32-Bit- als auch 64-Bit-Versionen.

Wie Peter Monnerjahn gerade auf dem heise Newsticker vermeldet, ist dieses Wochenende eine aktualisierte Version von Linux Mint (Version 8, Codename Helena) erschienen.

Hier ein paar Auszüge:

Wie gewohnt baut die Distribution auf dem aktuellen Ubuntu auf, also der Version 9.10 (Karmin Koala). Dadurch sind der Kernel 2.6.31, Gnome 2.28 und Xorg 7.4 mit an Bord  ebenso wie die Intel-Grafiktreiber-Architektur UXA, der Bootloader Grub2 und Ext4 als Standarddateisystem.

Anders als bei Ubuntu und vielen anderen Linux-Distributionen werden bei Linux Mint die wichtigsten Multimedia-Codecs bereits mit installiert, so dass MP3s, DVDs und YouTube auf Anhieb funktionieren.

Neben Windows 7 habe ich zur Zeit eine ältere Version von Linux Mint auf der Platte (die in Kürze aktualisiert wird). Was mir an Mint so gefällt: Man hat das schlichte Design eines Gnome-Desktops, der sich aber nicht so bieder braun zeigt wie Ubuntu, sondern in schicken Schwarz- und Grüntönen glänzt. Auch Details wie das Startmenü oder der Software Manager wissen zu gefallen.

Momentan hat Linux es bei mir zwar schwer, dank Windows 7 überhaupt mal gebootet zu werden… aber es sind Distributionen wie Ubuntu und Mint, die Linux in den letzten Jahren vom Nischenprodukt zur passenden Lösung für die Rechner von Mutti und Opi gemacht haben.

Der Titel lässt es schon vermuten: Nur Ubuntu anzuschauen, hat mir keine Ruhe gelassen. Deswegen habe ich auch Kubuntu getestet. Und für besser befunden. Wieso? Bitte weiterlesen.

Zuerstmal: Worin unterscheiden sich die beiden Distributionen überhaupt?
weiter…